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# 细胞交互 细胞交互的核心是给分子机制带来两面性,需要照顾到两种细胞两套机制的嵌套操作。 # 文章变量变化 表型嵌套 多元变量 直接机制 多元细胞体系 # 关键逻辑环节 选择前人开发好的成熟细胞交互模型。 什么细胞调控了什么细胞? donor & recipient 受体细胞更重要 一般只涉及二元调控 细胞交互的途径是什么? 通过细胞接触 细胞膜受体感受信号 与信号通路模式相似 单独信号分子 直接从细胞分泌的分子 蛋白、小分子、代谢产物 信号分子 + 载体 囊泡( Vesicle )运输 囊泡运输非编码 RNA →...
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# ceRNA ceRNA 的基本框架:把两套 RNA-RNA 交互作用叠加在一起就成了 ceRNA,其中有一个 miRNA 是共用的。三个变量,一个 miRNA 两个靶基因。本质上是 miRNA 作用机制的升级。 两个内源 RNA 之间的互相竞争性结合 miRNA ,从而对彼此的表达产生影响。 一个 miRNA 结合的靶基因可能有上百个,而 mRNA 的 3’UTR 和大量的 非编码 RNA 上,也有远远不止一个的 miRNA 识别元件( MRE , miRNA recognition elements )。 # 新型研究方法 针对 RISC 复合体 → 拉 AGO2 → 测序被拉下的...
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细胞交互的半套机制,就是从哪里来到哪里去的问题只研究一半: 研究一种供体细胞的病理过程,说明这种病理过程中会释放某个循环分子,这个分子可以作为疾病的 Biomarker 先提出发现了一个分子伴随疾病的发生有特异性表达增高的现象(一般是研究增高,致病因素),先说明这个分子可以作为 Biomarker ,然后研究某一种受体细胞接受了这个信号分子之后发生与疾病相关的表型过程。 上述能比较好的在临床资源中筛选到。 # 半套研究模式 量力而行。低分的文章没有必要执着于跟主变量关系相对远的机制细节。 蛋白修饰:忽视上游激酶 DNA 甲基化:忽视上游甲基化酶 RNA 修饰 …… # 套路步骤 #...
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16 字口诀:细胞交互、 横纵兼容、分泌吸收、跨越回复 # 数据扩充 单从受体细胞的效应途径看, miRNA 介导靶基因调节的研究设计和数据套路荧光素酶报告基因实验,以及反正正、反反反的 Rescue 是一致的,也符合结合位点验证规则。但是因为涉及到了 2 种细胞的交互作用,可想而知数据内容上会有不小的扩充: 供体细胞里 miRNA 的表达情况 miRNA 分泌情况 包裹在囊泡中的 miRNA 是否被受体细胞吸收 # 套路概述 上半部 供体细胞在疾病中介导主变量 miRNA 的表达改变 检测细胞培养上清中分泌的囊泡数量以及内含的 miRNA...